More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3698 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 570 aa  1107    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1176  stage II sporulation E  36.65 
 
 		 642 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.95059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5293  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 		 632 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.948365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0232  Stage II sporulation E family protein  33.98 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66837  decreased coverage  0.000564491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.49 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  27.82 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  27.03 
 
 		 648 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 760 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.93 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.41 
 
 		 708 aa  98.2  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3249  serine phosphatase  33.87 
 
 		 309 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 744 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 545 aa  91.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2083  Stage II sporulation E family protein  32.63 
 
 		 556 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.611306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.8 
 
 		 1045 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  24.78 
 
 		 706 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.63 
 
 		 572 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  26.49 
 
 		 687 aa  90.5  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  24.18 
 
 		 705 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.87 
 
 		 649 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.27 
 
 		 579 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  27.83 
 
 		 645 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.2 
 
 		 480 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 851 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.77 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  24.56 
 
 		 716 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 		 693 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  31.82 
 
 		 262 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.81 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.63 
 
 		 743 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.76 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 688 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 		 697 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  31.6 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  25.7 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.59 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.74 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.4 
 
 		 748 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  37.17 
 
 		 828 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.19 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  30.04 
 
 		 612 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  25.73 
 
 		 1087 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 		 642 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 410 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.56 
 
 		 1079 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 		 757 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  26.98 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.25 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 1385 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.8 
 
 		 602 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  27.96 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  28.29 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  28.47 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.36 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.05 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  32.07 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.28 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.6 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  30.65 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.03 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.94 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  31.78 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.9 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  25.53 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  27.08 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.05 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.13 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  34.83 
 
 		 723 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  33.2 
 
 		 692 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.46 
 
 		 378 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.08 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.56 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  26.14 
 
 		 1087 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  28.7 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5805  putative GAF sensor protein  35.19 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.09 
 
 		 1332 aa  78.2  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 		 1432 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.37 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.11 
 
 		 672 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  22.71 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  24.9 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 721 aa  77.8  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.95 
 
 		 1004 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 700 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.44 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  31.39 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  34.5 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  27.17 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  30.04 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.96 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  39.68 
 
 		 772 aa  77  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  26.09 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.03 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>