More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3654 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  100 
 
 		 329 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  45.45 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  48.75 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  40.95 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  38.23 
 
 		 662 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  42.86 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  39.53 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  36.06 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  38.11 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  35.56 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  34.67 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  39.86 
 
 		 309 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  35.55 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  39.02 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  35.22 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  34.88 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  33.23 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  38.85 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.88 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.54 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  33.43 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  32.92 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  32.92 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  32.92 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  36.52 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  32.92 
 
 		 320 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  36.52 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  33.03 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  32.65 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  33.23 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  34.44 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  34.44 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  32.83 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  34.22 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.36 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  32.86 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  36.13 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  31.45 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  34.28 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  34.28 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  34.28 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  32.56 
 
 		 359 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.48 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  29.14 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  33 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.2 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  29.78 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.87 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  24.67 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  31.35 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  31.35 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  38.82 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  23.92 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  33.92 
 
 		 405 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.3 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  27.87 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.87 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  27.87 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  27.87 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  23.59 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  23.59 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.53 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  23.59 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  23.59 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  33.65 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  23.73 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  30.97 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  23.73 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  26.32 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.9 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  22.97 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.61 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.31 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.97 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.58 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.61 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  22.97 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.97 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  23.34 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>