More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3588 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  829    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  58.82 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  52.22 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  53.49 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  59.79 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  54.42 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.37 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  51.33 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 413 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 413 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 413 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  49.5 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  50.12 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  49.1 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  50 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  49 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 420 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  50.42 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  50.92 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  45.43 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 453 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 450 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 509 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  38.86 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  40.73 
 
 		 429 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.06 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 442 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.31 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.66 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 474 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  34.11 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.54 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.32 
 
 		 403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  30.54 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.09 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.45 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>