131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3575 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 217 aa  397  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  66.37 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  52.82 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  42.03 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  46.76 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  47.32 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  40.48 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.36 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  38.42 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.29 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  45.54 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  43.7 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.24 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  43.12 
 
 		 424 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  39.84 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  33.71 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.26 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  40.97 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  42.11 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.84 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  38.55 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  41.75 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  38.67 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.83 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.83 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  42.99 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  40.83 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.45 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  39.76 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 		 593 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.95 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  39.04 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  38.02 
 
 		 560 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  43.65 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  35.42 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  41.13 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 		 565 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 		 564 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.53 
 
 		 576 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 126 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38.61 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 		 124 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.11 
 
 		 539 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.57 
 
 		 697 aa  52  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35.96 
 
 		 519 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 632 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  29.61 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  40.22 
 
 		 578 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  35.05 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  41.3 
 
 		 605 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 126 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  38.83 
 
 		 124 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.5 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  37.12 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 130 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  27.56 
 
 		 121 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 590 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 528 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.65 
 
 		 124 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>