140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3510 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  55.56 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  51.34 
 
 		 224 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  51.12 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  49.5 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  49.75 
 
 		 202 aa  184  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  52.53 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  54.14 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  49.73 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  49.72 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  50.28 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  44.85 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  43.54 
 
 		 249 aa  147  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 181 aa  141  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  44.81 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  48.02 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  44.51 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  41.81 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  46.82 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  32.95 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  31.79 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  31.79 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  35.34 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  35.34 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  35.34 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  35.34 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  35.34 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  35.81 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 121 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 134 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  38.2 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  26.62 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  40.51 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  26.95 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.7 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  42.35 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 226 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 107 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  36.36 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 108 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  29.5 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  40.35 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  52.83 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  42.68 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.38 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  36.13 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 113 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  27.23 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25.36 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  30.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  24.42 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  30.99 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>