198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3483 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
146 aa  289  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  63.12 
 
 
154 aa  189  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.86 
 
 
155 aa  181  2e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60.87 
 
 
156 aa  182  2e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.82 
 
 
153 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.03 
 
 
153 aa  176  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.03 
 
 
153 aa  176  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  59.03 
 
 
153 aa  176  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.75 
 
 
151 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  59.44 
 
 
145 aa  172  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.56 
 
 
147 aa  171  3e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.57 
 
 
151 aa  171  4e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  56.16 
 
 
172 aa  170  7e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.86 
 
 
167 aa  169  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.88131e-06  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  55.63 
 
 
157 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.04 
 
 
150 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.5 
 
 
158 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.67 
 
 
151 aa  167  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.71916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  52.41 
 
 
160 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  56.55 
 
 
145 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  58.27 
 
 
162 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.20118e-08  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.86 
 
 
158 aa  163  6e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.68 
 
 
163 aa  162  1e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.94 
 
 
163 aa  160  4e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.14 
 
 
155 aa  160  5e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  55.47 
 
 
150 aa  160  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.62 
 
 
152 aa  157  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.01 
 
 
158 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.47 
 
 
155 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.7 
 
 
149 aa  143  8e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98269e-10 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.66 
 
 
178 aa  138  2e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.67 
 
 
178 aa  133  7e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.73 
 
 
171 aa  128  2e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  39.16 
 
 
184 aa  118  2e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.87 
 
 
161 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.8 
 
 
191 aa  112  1e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  40.88 
 
 
144 aa  107  4e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.73 
 
 
153 aa  108  4e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  40.3 
 
 
163 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  41.55 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  41.55 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.55 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.3 
 
 
149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  41.55 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  41.55 
 
 
163 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.3 
 
 
149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.42 
 
 
153 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.9 
 
 
233 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.55 
 
 
163 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.74 
 
 
149 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.85 
 
 
163 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  39.13 
 
 
147 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 
151 aa  103  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  40.58 
 
 
149 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  40.15 
 
 
144 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  41.04 
 
 
147 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.03 
 
 
149 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.03 
 
 
149 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.29 
 
 
149 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.26 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.86 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.52 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.3 
 
 
154 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.16 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  34.75 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  37.96 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.56 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.01 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.56 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  36.88 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  38.97 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.46 
 
 
165 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.68 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.82 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 
138 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 
138 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.59 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  35.25 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.06 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.81 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  35.04 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  34.56 
 
 
146 aa  84.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  36.57 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
154 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 
171 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.57 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  32.39 
 
 
160 aa  83.2  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  40.3 
 
 
140 aa  82  3e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.29 
 
 
175 aa  81.3  4e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.12 
 
 
144 aa  80.5  7e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 
143 aa  80.1  9e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  37.31 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>