More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3459 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  910    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  64.27 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  64.27 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  64.27 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  46.87 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  31.27 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.93 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.42 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 444 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  27.43 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  28.42 
 
 		 447 aa  100  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.09 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 478 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.34 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 401 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  28.27 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.05 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 435 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.39 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.48 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.53 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.39 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.77 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>