More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3370 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  77.27 
 
 		 134 aa  216  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  68.22 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  69.35 
 
 		 135 aa  170  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  63.78 
 
 		 135 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  70.49 
 
 		 150 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  58.74 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  58.52 
 
 		 135 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  61.72 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  60.63 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  58.91 
 
 		 130 aa  158  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  59.84 
 
 		 131 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  57.66 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  56.92 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  56.92 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  56.92 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  62.1 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  59.68 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  61.9 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  56.8 
 
 		 130 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  55.88 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  59.02 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  59.35 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  58.65 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  60.48 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  55.2 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  55.47 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  56.45 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  56.35 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  49.62 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  47.26 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 		 138 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  54.84 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  46.56 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  45.24 
 
 		 131 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 		 143 aa  94  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  38.71 
 
 		 143 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 133 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  37.9 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 147 aa  88.2  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  35.2 
 
 		 134 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.59 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.28 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.28 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.92 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.28 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 		 143 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  35.54 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.13 
 
 		 155 aa  84  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.58 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.62 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  28.35 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.11 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  37.19 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3901  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000831439  normal  0.164099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1383  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.37 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  28 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  35.65 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>