161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3324 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  41.84 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  27.93 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.81 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.78 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  32.7 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  32.16 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  28.24 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.48 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  37.35 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  29.17 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>