118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3312 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
263 aa  513  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  36.23 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  34.31 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  35.42 
 
 
340 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  32.93 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  35.16 
 
 
259 aa  131  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  35.42 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  36.53 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  34.09 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  36.13 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  36.55 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  36.18 
 
 
266 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  36.13 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  35.71 
 
 
253 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  35.08 
 
 
262 aa  118  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  37.13 
 
 
338 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  32.11 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  35.39 
 
 
261 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  33.96 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  33.96 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  37.13 
 
 
244 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  37.55 
 
 
291 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  34.84 
 
 
272 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  32.6 
 
 
218 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  38.4 
 
 
248 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  34.3 
 
 
270 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  38.49 
 
 
248 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  35.27 
 
 
246 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  35.25 
 
 
253 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  33.99 
 
 
256 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  34.2 
 
 
277 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.51 
 
 
232 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  36.02 
 
 
264 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  35.46 
 
 
260 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  36.07 
 
 
264 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  30.86 
 
 
251 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  34.02 
 
 
336 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  35.46 
 
 
260 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  34.94 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  33.85 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  34.43 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  35.66 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  35.63 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  33.85 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  35.63 
 
 
264 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  34.84 
 
 
264 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  36.07 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  34.43 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  35.46 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  33.85 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  34.96 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  34.66 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  34.96 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  34.96 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  30.84 
 
 
232 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  30.84 
 
 
232 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  34.26 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  35.23 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  32.26 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  33.73 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  30.16 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  29.18 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  32.11 
 
 
233 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  30.87 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  32 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  34.58 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  34.07 
 
 
262 aa  92  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  28.98 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  31.51 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  35.68 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  34.02 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  28.82 
 
 
225 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  32.46 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  29.37 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  29.22 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  33.86 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  29.2 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  31.09 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  29.39 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  37.14 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  37.14 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  32.11 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  29.83 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  29.29 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  31.5 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  28.27 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  27.53 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  29.22 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  29.2 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  30.61 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  30.86 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  25.44 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  27.68 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>