More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3189 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  53.5 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  53.9 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  54.17 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  55.24 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  48.54 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  50.66 
 
 		 272 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  42.93 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  46.82 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  48.91 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  49.4 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  49.42 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  50.67 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  48.15 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  47.44 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  46.49 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  54.36 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  51.03 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  48.87 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  48.87 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  50.32 
 
 		 182 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  46.11 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  50 
 
 		 156 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  49.36 
 
 		 165 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  37.78 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  46.75 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.63 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  38.75 
 
 		 169 aa  86.3  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.92 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  42.36 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  47.58 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  53.05 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  34.57 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  35.93 
 
 		 165 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.36 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 144 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 171 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.95 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.24 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  30.96 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.9 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  34.48 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>