More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3182 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
226 aa  437  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.37 
 
 
233 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.13 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  46.12 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  44.25 
 
 
220 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.61 
 
 
224 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  44.4 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  42.47 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  41.48 
 
 
225 aa  138  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.34 
 
 
221 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  39.55 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  41.5 
 
 
265 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  37.34 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  38.36 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  36.68 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.7 
 
 
213 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.01 
 
 
211 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.49 
 
 
213 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  31.25 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.19 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  34.3 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  36.19 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.19 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.57 
 
 
233 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  35.12 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  34.53 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.63 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.63 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.21 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.46 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  34.62 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  34.62 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  29.81 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.62 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.98 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.88 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  31.98 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  30.81 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  33.93 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.71 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  31.65 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.32 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  32.87 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  36.07 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  32.37 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.18 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  32.74 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.64 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  36.63 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  47.37 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  30.94 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  32.02 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.16 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.36 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.07 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  46 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  43.43 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  30.26 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.42 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  30.26 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  35.75 
 
 
196 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  33.48 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  31.94 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.89 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  29.77 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.96 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  30.65 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  29.96 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.36 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  33.01 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  29.77 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.24 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.29 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  45.45 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  32.84 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.41 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  31.96 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.67 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  33.99 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 
828 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  32.31 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  43.75 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  31.5 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  34.69 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  30.49 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>