More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3157 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
306 aa  610  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  71.15 
 
 
315 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  68.18 
 
 
310 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  70.33 
 
 
311 aa  424  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 
308 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  67.43 
 
 
322 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 
330 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  70.87 
 
 
314 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 
321 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  64.38 
 
 
307 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
310 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  68.83 
 
 
314 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  64.38 
 
 
307 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 
307 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  64.05 
 
 
307 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  62.91 
 
 
307 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 
319 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  61.92 
 
 
307 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  61.24 
 
 
323 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  63.93 
 
 
310 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  61.17 
 
 
333 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 
308 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  62.25 
 
 
306 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
335 aa  362  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  61.44 
 
 
310 aa  358  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
307 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  60.97 
 
 
312 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  62.09 
 
 
321 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 
312 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 
312 aa  341  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
340 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 
317 aa  308  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
309 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
305 aa  281  9e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
304 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
304 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
315 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
309 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
303 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
311 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
305 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
304 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
311 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
303 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
309 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
312 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  44.05 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
305 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
300 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  271  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 
306 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
309 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.81 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
316 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 
312 aa  267  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
320 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
301 aa  266  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
304 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
308 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
298 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
303 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
323 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
318 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 
303 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
301 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 
309 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
313 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
306 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
308 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
316 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
312 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
303 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 
305 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>