More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3138 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
362 aa  725    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.21 
 
 
287 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  79.29 
 
 
293 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.54 
 
 
303 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.78 
 
 
303 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.54 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.14 
 
 
293 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.94 
 
 
337 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  76.9 
 
 
290 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  75.99 
 
 
327 aa  421  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.74 
 
 
367 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  67.8 
 
 
332 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  76.67 
 
 
314 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.64 
 
 
339 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.07 
 
 
302 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.09 
 
 
317 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.68 
 
 
309 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.86 
 
 
322 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  71.43 
 
 
319 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.27 
 
 
302 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72 
 
 
329 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  71.38 
 
 
315 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.61 
 
 
298 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.76 
 
 
307 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.82 
 
 
352 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.18 
 
 
307 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.62 
 
 
329 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.7 
 
 
312 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.79 
 
 
306 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.59 
 
 
297 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.94 
 
 
303 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.2 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.2 
 
 
279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.2 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  64.84 
 
 
318 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.58 
 
 
298 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  62.41 
 
 
279 aa  359  4e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  59.85 
 
 
279 aa  340  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  47.97 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.63 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.81 
 
 
268 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 
253 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.41 
 
 
253 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  48.02 
 
 
253 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.02 
 
 
253 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  46.4 
 
 
258 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  46.86 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.53 
 
 
266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.79 
 
 
253 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  47.43 
 
 
251 aa  239  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  48.41 
 
 
260 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.64 
 
 
255 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  47.6 
 
 
253 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  48.02 
 
 
253 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  49.4 
 
 
255 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  47.43 
 
 
254 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
254 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  48.47 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.81 
 
 
264 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  44.6 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.27 
 
 
254 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.43 
 
 
253 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.06 
 
 
254 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.63 
 
 
253 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.24 
 
 
255 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  45.6 
 
 
256 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  48.02 
 
 
265 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 
253 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  45.42 
 
 
262 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.63 
 
 
253 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.21 
 
 
253 aa  229  6e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  46.61 
 
 
258 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.03 
 
 
274 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44 
 
 
257 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  44.05 
 
 
258 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.05 
 
 
256 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.22 
 
 
257 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.41 
 
 
259 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.06 
 
 
262 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 
262 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  48.22 
 
 
370 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.06 
 
 
262 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.06 
 
 
262 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  46.83 
 
 
263 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  46.83 
 
 
257 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 
263 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.66 
 
 
262 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.83 
 
 
263 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  44.58 
 
 
257 aa  223  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.82 
 
 
273 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  47.22 
 
 
261 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.22 
 
 
255 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 
263 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>