More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3087 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  100 
 
 
360 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  70.09 
 
 
398 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  75.71 
 
 
416 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  75.82 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  77.46 
 
 
403 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  69.49 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  68.62 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.24 
 
 
328 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.83 
 
 
318 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  70.21 
 
 
356 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  66.89 
 
 
369 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  69.23 
 
 
359 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  67.83 
 
 
336 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  74.06 
 
 
315 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  76.95 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  57.66 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  65.57 
 
 
369 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  68.86 
 
 
376 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  63.87 
 
 
327 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  69.66 
 
 
406 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  65.07 
 
 
402 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  59.56 
 
 
473 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  59.49 
 
 
381 aa  381  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.59 
 
 
359 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  56.9 
 
 
456 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  64.46 
 
 
396 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  55.83 
 
 
406 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  57.43 
 
 
403 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  62.7 
 
 
395 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  55.82 
 
 
401 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  60.41 
 
 
361 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.72 
 
 
392 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.37 
 
 
392 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  62.37 
 
 
392 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  57.86 
 
 
446 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  52.19 
 
 
307 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.72 
 
 
314 aa  311  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  50.97 
 
 
312 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  48.63 
 
 
305 aa  289  7e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  48.63 
 
 
305 aa  288  8e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  49.12 
 
 
304 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  45.58 
 
 
309 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  45.51 
 
 
326 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  49.15 
 
 
310 aa  275  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  48.93 
 
 
293 aa  268  8e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  45.03 
 
 
322 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.03 
 
 
321 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  45.03 
 
 
321 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.03 
 
 
321 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  45.03 
 
 
322 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  45.03 
 
 
322 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  44.2 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.03 
 
 
322 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  45.51 
 
 
327 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  45.03 
 
 
322 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  45.03 
 
 
322 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  50 
 
 
314 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  44.85 
 
 
322 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  44.62 
 
 
322 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  45.72 
 
 
326 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  46.15 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  48.19 
 
 
312 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  41.06 
 
 
306 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.14 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  41.25 
 
 
344 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  41.78 
 
 
311 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.23 
 
 
312 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.02 
 
 
328 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.02 
 
 
328 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  40.45 
 
 
305 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  40.45 
 
 
305 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  40.45 
 
 
305 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  40.45 
 
 
305 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  40.45 
 
 
305 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  42.14 
 
 
305 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.48 
 
 
304 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  42.81 
 
 
329 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.79 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  41.45 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  41.79 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  40.67 
 
 
332 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  41.61 
 
 
329 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.35 
 
 
304 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  40.45 
 
 
326 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.95 
 
 
334 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  43.75 
 
 
345 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  40.55 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.27 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  43.38 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  40.21 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  39.32 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  39.61 
 
 
332 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  39.66 
 
 
304 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  41.1 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>