More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3036 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  79.83 
 
 		 252 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  79.41 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  76.92 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  78.35 
 
 		 406 aa  362  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  78.11 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.52 
 
 		 242 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.37 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 231 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  68.44 
 
 		 246 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.8 
 
 		 246 aa  335  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.58 
 
 		 252 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  70.76 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  69.92 
 
 		 250 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  64.62 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  69.58 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.25 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  60.08 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  60.26 
 
 		 257 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.14 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.43 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.66 
 
 		 236 aa  278  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  57.71 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.23 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  61.33 
 
 		 238 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  61.33 
 
 		 247 aa  275  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.33 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  60.89 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  60.89 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  60.89 
 
 		 236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  60.89 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.24 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.38 
 
 		 231 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  60.7 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  59.39 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  58.67 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.7 
 
 		 238 aa  265  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.21 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.95 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  58.55 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.88 
 
 		 239 aa  256  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  53.45 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  59.73 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.05 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 242 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  59.19 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  51.9 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.89 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 229 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 230 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  52.44 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 240 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  49.8 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  51.01 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.5 
 
 		 236 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 231 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.78 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  52.56 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.3 
 
 		 241 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 224 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  46.88 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>