More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2985 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  69.66 
 
 
181 aa  259  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  65 
 
 
181 aa  245  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  66.3 
 
 
182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  66.11 
 
 
180 aa  239  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  65.38 
 
 
188 aa  237  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  66.3 
 
 
182 aa  237  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  60.89 
 
 
181 aa  224  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  61.2 
 
 
183 aa  222  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  60.89 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  61.29 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  61.29 
 
 
186 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  60.62 
 
 
161 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  58.02 
 
 
168 aa  190  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  54.94 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  55.83 
 
 
180 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  62.15 
 
 
177 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  50.92 
 
 
166 aa  167  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  46.15 
 
 
185 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  51.55 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  49.69 
 
 
184 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  52.47 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  50 
 
 
162 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.09 
 
 
197 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  48.12 
 
 
162 aa  157  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.96 
 
 
162 aa  157  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  47.17 
 
 
164 aa  157  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  54.19 
 
 
159 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.38 
 
 
162 aa  144  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  47.53 
 
 
163 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  47.83 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.3 
 
 
215 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  43.04 
 
 
162 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  43.6 
 
 
183 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.01 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.45 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  42.44 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  46.54 
 
 
213 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  46.45 
 
 
162 aa  131  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  44.77 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  45.4 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  44.65 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.4 
 
 
164 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  44.08 
 
 
156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  47.9 
 
 
178 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  46.58 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  43.9 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  42.46 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  44.51 
 
 
225 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  42.51 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  42.77 
 
 
200 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  43.15 
 
 
159 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.65 
 
 
173 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.38 
 
 
167 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  42.11 
 
 
164 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.72 
 
 
167 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.03 
 
 
173 aa  121  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  41.34 
 
 
197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  41.34 
 
 
197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  40.79 
 
 
169 aa  120  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  41.34 
 
 
197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.94 
 
 
154 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.79 
 
 
164 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  41.9 
 
 
197 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  41.34 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  43.54 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  37.75 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  44.79 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  41.45 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.36 
 
 
155 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  40.23 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  42.36 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  43.64 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.15 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.51 
 
 
185 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  41.92 
 
 
219 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  47.68 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  37.31 
 
 
213 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  41.28 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.78 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.33 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.88 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.88 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  42.51 
 
 
185 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.2 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  41.89 
 
 
158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.2 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.33 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  41.89 
 
 
156 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  42.2 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  41.06 
 
 
187 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  39.04 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.56 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  39.88 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  40.28 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  41.22 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>