More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2983 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
486 aa  936    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  56.34 
 
 
517 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  56.84 
 
 
505 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  59.21 
 
 
509 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.45 
 
 
539 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  54.21 
 
 
527 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  58.64 
 
 
517 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  54.55 
 
 
471 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  57.17 
 
 
480 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  53.62 
 
 
502 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  53.41 
 
 
543 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.09 
 
 
509 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.32 
 
 
472 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  50 
 
 
476 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.51 
 
 
465 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  53.73 
 
 
478 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  50.73 
 
 
551 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  49.89 
 
 
452 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.91 
 
 
532 aa  359  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  52.23 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.38 
 
 
449 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.35 
 
 
484 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  50.11 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.3 
 
 
462 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  51.5 
 
 
489 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  50.33 
 
 
457 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.94 
 
 
508 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  52.78 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  50.11 
 
 
455 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.11 
 
 
455 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.11 
 
 
455 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  48.97 
 
 
515 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  50.54 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.65 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.8 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  46.64 
 
 
491 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.3 
 
 
446 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.91 
 
 
453 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.54 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.46 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  32.56 
 
 
452 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.05 
 
 
452 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.44 
 
 
444 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  35.02 
 
 
457 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.59 
 
 
451 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.69 
 
 
449 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.57 
 
 
452 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.47 
 
 
448 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.1 
 
 
447 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.98 
 
 
449 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.19 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  33.33 
 
 
440 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.21 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.03 
 
 
448 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  32.69 
 
 
444 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  30.82 
 
 
448 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.05 
 
 
453 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  37.11 
 
 
451 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  29.28 
 
 
456 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.75 
 
 
436 aa  171  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  25.64 
 
 
435 aa  170  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  37.09 
 
 
439 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  35.31 
 
 
501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.48 
 
 
464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  27.65 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.78 
 
 
424 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  34.46 
 
 
432 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.98 
 
 
442 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  28.6 
 
 
462 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.24 
 
 
442 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.3 
 
 
451 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.59 
 
 
443 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.02 
 
 
444 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  38.25 
 
 
455 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.08 
 
 
452 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  29.41 
 
 
430 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.31 
 
 
451 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  29.01 
 
 
429 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  27.1 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  27.8 
 
 
444 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.14 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  27.74 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  33.25 
 
 
453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  37.34 
 
 
455 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  27.68 
 
 
444 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  31.03 
 
 
445 aa  153  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  28.27 
 
 
442 aa  152  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  27.9 
 
 
444 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  27.68 
 
 
444 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  26.37 
 
 
440 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  27.68 
 
 
444 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  27.68 
 
 
444 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  29.28 
 
 
428 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  23.85 
 
 
435 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  27.68 
 
 
444 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  29.28 
 
 
428 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  23.85 
 
 
435 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  35.49 
 
 
455 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  29.28 
 
 
428 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  27.8 
 
 
436 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>