More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2979 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  69.12 
 
 
203 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  69.12 
 
 
203 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  68.63 
 
 
203 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  69.19 
 
 
201 aa  254  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  69.19 
 
 
203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  68.69 
 
 
205 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  66.5 
 
 
210 aa  247  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  65.33 
 
 
215 aa  247  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  65.17 
 
 
207 aa  242  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  64.18 
 
 
202 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  61.76 
 
 
204 aa  229  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  63.24 
 
 
208 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  60.09 
 
 
223 aa  226  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  63.77 
 
 
220 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  63.9 
 
 
199 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  60.19 
 
 
202 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  61.06 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  62.56 
 
 
204 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 
208 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  62.69 
 
 
200 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  61.39 
 
 
205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 
226 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  64.65 
 
 
212 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.71 
 
 
217 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  54.75 
 
 
227 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  53.51 
 
 
238 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  60.61 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 
204 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.86 
 
 
222 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 
193 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.03 
 
 
215 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 
233 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  52.48 
 
 
218 aa  184  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
214 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 
218 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 
218 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 
214 aa  174  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 
223 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 
221 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 
221 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 
208 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  46.38 
 
 
210 aa  168  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 
217 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 
220 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 
214 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 
217 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  50.75 
 
 
227 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 
219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 
202 aa  164  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 
216 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.78 
 
 
217 aa  161  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  52 
 
 
201 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  47.74 
 
 
220 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
219 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 
219 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  50.51 
 
 
199 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 
219 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
207 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  48.74 
 
 
201 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
215 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
220 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 
215 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 
215 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 
214 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
215 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 
213 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  51.5 
 
 
203 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 
239 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
218 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  49.4 
 
 
187 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 
209 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 
220 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 
216 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 
217 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  46 
 
 
217 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>