More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2929 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  70.93 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  65.5 
 
 		 265 aa  348  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  65.5 
 
 		 261 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  66.41 
 
 		 264 aa  342  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  63.71 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  65.25 
 
 		 265 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  65.37 
 
 		 263 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  63.04 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  62.65 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  60.23 
 
 		 271 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  60.62 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.18 
 
 		 687 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  64.45 
 
 		 263 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  62.35 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  60.31 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 		 258 aa  304  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  59.29 
 
 		 261 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  58.5 
 
 		 261 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  60.38 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  60.63 
 
 		 261 aa  298  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  58.91 
 
 		 263 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  58.67 
 
 		 287 aa  291  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  58.1 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  53.15 
 
 		 267 aa  278  7e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  55.34 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  51.56 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 248 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.55 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50.98 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  46.69 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51.57 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.24 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 251 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.86 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.91 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.96 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  43.36 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 654 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 650 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.29 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.08 
 
 		 655 aa  208  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.91 
 
 		 253 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>