More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2921 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 339 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  62.46 
 
 		 293 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  58.14 
 
 		 304 aa  340  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  56.91 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  61.54 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  57.99 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 		 319 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  59.14 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  54.08 
 
 		 332 aa  312  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  56.81 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  56.1 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  56.86 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  56.52 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  53.97 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 307 aa  295  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  53.55 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  50.31 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.25 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  53.75 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  51.51 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.01 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  57.05 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.22 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  51.44 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  51 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  53.04 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  49.33 
 
 		 335 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  50.66 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.36 
 
 		 317 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  48.14 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  48.14 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  47.65 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  52.49 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  47.13 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.3 
 
 		 323 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  44.75 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.92 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.92 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.39 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 535 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  43.88 
 
 		 624 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 		 622 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.97 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.33 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  40.81 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  38.61 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  44.81 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.15 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  38.61 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  43.89 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  43.89 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 478 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  47.55 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 534 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.88 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  42.09 
 
 		 586 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  37.87 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.05 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  37.42 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.68 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 472 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  44.13 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  43.02 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  35.43 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  35.46 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  37.17 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  40.51 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  40.44 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  42.53 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.05 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  36.96 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>