More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2903 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
410 aa  782    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  57.25 
 
 
420 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  55.25 
 
 
414 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  55.47 
 
 
406 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  55.83 
 
 
407 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
419 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  51.83 
 
 
432 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  51 
 
 
409 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  53.28 
 
 
403 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  54.46 
 
 
429 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  50.38 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  53.45 
 
 
406 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  51.13 
 
 
421 aa  322  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  52.27 
 
 
410 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  51.72 
 
 
419 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  49.22 
 
 
380 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
417 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
417 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
417 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  50.88 
 
 
419 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  52.01 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  52.01 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  39.75 
 
 
410 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  40.7 
 
 
404 aa  264  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  40.35 
 
 
408 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40 
 
 
405 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  41 
 
 
415 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.84 
 
 
404 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
406 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.84 
 
 
404 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  56.72 
 
 
297 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  50.17 
 
 
297 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  41.1 
 
 
412 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  38.81 
 
 
404 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  38.5 
 
 
413 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  40.4 
 
 
418 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  38.65 
 
 
404 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 
404 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  37.62 
 
 
410 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.15 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  39.8 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  38.64 
 
 
429 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  39.01 
 
 
438 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 
223 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  40.05 
 
 
398 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.56 
 
 
405 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  39.6 
 
 
404 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  39.8 
 
 
405 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  39.8 
 
 
405 aa  235  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  66.99 
 
 
234 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  36.25 
 
 
410 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  38.54 
 
 
411 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  61.86 
 
 
213 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  36.93 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  39.86 
 
 
411 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  65.2 
 
 
216 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  54.9 
 
 
225 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  56.44 
 
 
278 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 
215 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2319  phosphoserine phosphatase SerB  61.35 
 
 
213 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  51.38 
 
 
240 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  31.73 
 
 
400 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
213 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.31 
 
 
279 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
299 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
298 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 
284 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  46.61 
 
 
307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 
325 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  47.48 
 
 
326 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 
298 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  47.48 
 
 
326 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  47.48 
 
 
326 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  42.37 
 
 
298 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  50.52 
 
 
322 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  35.23 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.7 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  46.53 
 
 
309 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  38.25 
 
 
310 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.58 
 
 
279 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  43.85 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  45.8 
 
 
325 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 
322 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.61 
 
 
279 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  47.22 
 
 
296 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.76 
 
 
281 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  41.7 
 
 
285 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>