More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2781 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2781  Patatin  100 
 
 		 306 aa  587  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  37.55 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  40.31 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  38.4 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  37.93 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  39.52 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  39.58 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.69 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  38.25 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  37.85 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  34.91 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  35.2 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  35.77 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  38.67 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  36.11 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  38.89 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.44 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.44 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.44 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  37.59 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.68 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  36.59 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.71 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  31.56 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  36.36 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  37.35 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  38.72 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  32.34 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27.78 
 
 		 379 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  27.61 
 
 		 735 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.33 
 
 		 760 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  37.7 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.88 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.95 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 757 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.43 
 
 		 757 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.43 
 
 		 757 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 757 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 757 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.24 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.1 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 757 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 757 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  28.63 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  28.63 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.35 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.95 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.85 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  29.35 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.52 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.61 
 
 		 253 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.22 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  36.56 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  34.97 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.28 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.26 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.05 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.72 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.36 
 
 		 798 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.76 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  32.63 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.36 
 
 		 796 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  34.95 
 
 		 804 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.71 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.71 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  37.34 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.62 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.01 
 
 		 728 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.24 
 
 		 263 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  37.5 
 
 		 259 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  27.78 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.78 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.12 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.59 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.69 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.22 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.78 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.24 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.55 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.23 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  36.63 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.32 
 
 		 741 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.78 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.62 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  33.51 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.68 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.57 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.78 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28.24 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  36.78 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  36.78 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  34.05 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.01 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.95 
 
 		 727 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.22 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  32.54 
 
 		 920 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  33.51 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  33.01 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 728 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.01 
 
 		 803 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>