194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2685 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  50.56 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.92 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  53.93 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  51.14 
 
 		 180 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  52.75 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  47.7 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  47.7 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  48.55 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  47.7 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  46.55 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  46.55 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  49.72 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.98 
 
 		 183 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 178 aa  151  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  45.35 
 
 		 390 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  48.54 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  45.4 
 
 		 183 aa  148  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.34 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.98 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.77 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  41.81 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  39.76 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  39.76 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  40.8 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  40.46 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 178 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  121  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  40.94 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.43 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  37.95 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  37.14 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  34.71 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  38.82 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.76 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.5 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  38.55 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  35.5 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  33.92 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  33.92 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.9 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  33.92 
 
 		 173 aa  99.4  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.57 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  33.92 
 
 		 173 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.75 
 
 		 174 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  32.75 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  32.16 
 
 		 173 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.36 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.72 
 
 		 180 aa  91.7  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 		 175 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 		 182 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.43 
 
 		 183 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  35.09 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  31.88 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  32.94 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.27 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.66 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.55 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.97 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.49 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.41 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.37 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.88 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  29.82 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.97 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.38 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.53 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.88 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.11 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  36.62 
 
 		 75 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>