123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2654 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
190 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  63.49 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  61.05 
 
 
190 aa  217  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  54.3 
 
 
188 aa  190  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  53.72 
 
 
190 aa  174  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.06 
 
 
215 aa  148  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.03 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  43.06 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.89 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.29 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  44.85 
 
 
209 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.5 
 
 
210 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.9 
 
 
222 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.32 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.69 
 
 
210 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  37.57 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.47 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.37 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.13 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.44 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.85 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.39 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.77 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  39.73 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  36.99 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.46 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.96 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  37.69 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  33.68 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.93 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  35.06 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.03 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  30 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.26 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  38.81 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.72 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.41 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  36.57 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.24 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.55 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.29 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  31.74 
 
 
225 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  29.14 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  35.03 
 
 
227 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  39.56 
 
 
132 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.64 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  30.2 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  28.49 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.51 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  35.14 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.82 
 
 
223 aa  58.9  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  35.66 
 
 
232 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  28.03 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  38.16 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  31.33 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  27.33 
 
 
223 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.74 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.59 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.51 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
286 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
208 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.19 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.45 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.94 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.01 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.88 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  32.52 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.86 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  27.62 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.08 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.52 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.72 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.93 
 
 
289 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.18 
 
 
208 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.74 
 
 
229 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  29.56 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.87 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  31.25 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.21 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  30.34 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.49 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.43 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.38 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.74 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.23 
 
 
244 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5629  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.33 
 
 
290 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.865293  normal  0.0329981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.12 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  27.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.37 
 
 
236 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
203 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.24 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.83 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.72 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  25.12 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.79 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>