25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2648 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  43.75 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  48 
 
 		 106 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  30.49 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  33.88 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  33.88 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  33.88 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  30.72 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  30.94 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  0.00000150811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  35.54 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  32.23 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 324 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  27.67 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.29 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 270 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>