43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2644 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  43.11 
 
 
230 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  47.59 
 
 
222 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  42.33 
 
 
225 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  42.31 
 
 
268 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  32.5 
 
 
223 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  36.59 
 
 
231 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  36.02 
 
 
250 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  31.71 
 
 
220 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  31.87 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  31.87 
 
 
223 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  31.87 
 
 
223 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  38.55 
 
 
248 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  31.87 
 
 
223 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  38.71 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  37.2 
 
 
234 aa  97.1  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  31.25 
 
 
221 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  31.87 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  34.97 
 
 
223 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  25.95 
 
 
198 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  37.65 
 
 
208 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  26.72 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  28.22 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  23.66 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  27.74 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  34.48 
 
 
105 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  33.72 
 
 
211 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  22.15 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  21.9 
 
 
189 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  21.38 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  21.09 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  21.09 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  25 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  21.09 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  20.69 
 
 
231 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  20.69 
 
 
231 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  20 
 
 
193 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  31.4 
 
 
202 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  35.94 
 
 
206 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.74 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>