More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2572 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  40.45 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.64 
 
 		 174 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 174 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 245 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.44 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 259 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  38.73 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.52 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  35.67 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.67 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.7 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.52 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.32 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
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NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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