285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2527 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
882 aa  1769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  38.61 
 
 
799 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 
829 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 
825 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.25 
 
 
808 aa  412  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.33 
 
 
837 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.11 
 
 
811 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  30.04 
 
 
815 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.89 
 
 
794 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.14 
 
 
928 aa  310  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
827 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.73 
 
 
903 aa  303  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
807 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
806 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  29.16 
 
 
891 aa  293  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.66 
 
 
922 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.48 
 
 
805 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.46 
 
 
813 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.77 
 
 
1015 aa  284  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
919 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 
873 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  44.59 
 
 
655 aa  269  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.3 
 
 
986 aa  269  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  27.14 
 
 
1355 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
1185 aa  263  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
832 aa  261  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
858 aa  257  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.78 
 
 
824 aa  247  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  27.19 
 
 
961 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.33 
 
 
859 aa  241  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  30.51 
 
 
604 aa  238  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.11 
 
 
1781 aa  238  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
984 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
806 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.91 
 
 
1093 aa  222  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.27 
 
 
805 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.12 
 
 
787 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
925 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 
932 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  29.89 
 
 
964 aa  153  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
766 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.36 
 
 
1129 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 
781 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.28 
 
 
785 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.85 
 
 
858 aa  127  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.42 
 
 
781 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
862 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  27.5 
 
 
1041 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
803 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.83 
 
 
1026 aa  115  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  24.61 
 
 
804 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
987 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27 
 
 
1041 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 
979 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  24.55 
 
 
1035 aa  112  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.09 
 
 
804 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  22.3 
 
 
750 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.26 
 
 
894 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.67 
 
 
972 aa  109  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.75 
 
 
1005 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.62 
 
 
1024 aa  106  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.23 
 
 
1035 aa  106  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.82 
 
 
763 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 
951 aa  104  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.53 
 
 
1019 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 
1017 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.4 
 
 
1289 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.54 
 
 
1033 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  29.57 
 
 
563 aa  103  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
1424 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  26.36 
 
 
1032 aa  101  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.74 
 
 
1028 aa  101  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.68 
 
 
558 aa  100  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
920 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
1079 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  26.43 
 
 
1066 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  26.43 
 
 
1050 aa  99.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  25.3 
 
 
1012 aa  100  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.46 
 
 
1044 aa  99.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  28.85 
 
 
564 aa  99.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  26.43 
 
 
1066 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  25.87 
 
 
1043 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.94 
 
 
607 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.41 
 
 
920 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  25.22 
 
 
897 aa  99.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.25 
 
 
1600 aa  99  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.66 
 
 
1030 aa  99  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.4 
 
 
1020 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.61 
 
 
743 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  29.95 
 
 
1045 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  28.9 
 
 
1076 aa  96.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  25.57 
 
 
1046 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.7 
 
 
1264 aa  96.3  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.65 
 
 
1063 aa  95.1  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 
1084 aa  95.5  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  25.11 
 
 
1029 aa  94.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 
1077 aa  94.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  31.28 
 
 
1024 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.17 
 
 
913 aa  94.7  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  25 
 
 
1036 aa  94.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>