More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2478 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 537 aa  1021    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  60.81 
 
 		 508 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  47.69 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  48.26 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 533 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  47.9 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  48.68 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 555 aa  363  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  46.39 
 
 		 535 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 513 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  46.22 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 558 aa  349  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 518 aa  346  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 514 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  45.7 
 
 		 521 aa  326  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 541 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 536 aa  320  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.91 
 
 		 601 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 477 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 513 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  47.33 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 502 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 535 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.08 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  46.68 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 495 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 497 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 528 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.33 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.41 
 
 		 503 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 514 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.87 
 
 		 513 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.69 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.04 
 
 		 510 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.5 
 
 		 500 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 519 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  39.83 
 
 		 501 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 507 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 501 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 607 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 503 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.54 
 
 		 495 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.54 
 
 		 495 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.54 
 
 		 495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.34 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  34.94 
 
 		 495 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  40 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38.64 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>