More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2325 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  100 
 
 
923 aa  1801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  45.53 
 
 
955 aa  572  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  44.43 
 
 
961 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  44.49 
 
 
934 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  40.45 
 
 
922 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 
927 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 
928 aa  354  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  35.46 
 
 
892 aa  295  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  34.43 
 
 
884 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 
925 aa  260  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  32.11 
 
 
929 aa  250  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 
923 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  31.74 
 
 
937 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
937 aa  237  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  31.74 
 
 
937 aa  237  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  29.05 
 
 
917 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 
938 aa  211  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.03 
 
 
928 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 
923 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.47 
 
 
879 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.22 
 
 
923 aa  184  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 
920 aa  180  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.27 
 
 
919 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 
953 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  36.2 
 
 
940 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 
911 aa  161  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 
1064 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 
946 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 
940 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 
918 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
889 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 
905 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 
904 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
950 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  33.76 
 
 
913 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  38.11 
 
 
936 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  35.64 
 
 
884 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
929 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 
894 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.34 
 
 
928 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 
927 aa  122  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 
903 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 
909 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 
916 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.32 
 
 
919 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.32 
 
 
919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.17 
 
 
910 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 
995 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  41.09 
 
 
930 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
1000 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  36.82 
 
 
240 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.14 
 
 
913 aa  101  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 
913 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.24 
 
 
915 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.89 
 
 
929 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 
919 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  37.93 
 
 
977 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 
916 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 
921 aa  92  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
921 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 
921 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  35.25 
 
 
921 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.97 
 
 
954 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
927 aa  87  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.21 
 
 
916 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 
897 aa  85.9  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 
967 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 
998 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  43.31 
 
 
910 aa  84  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 
951 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.91 
 
 
946 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.54 
 
 
973 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.92 
 
 
900 aa  79.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
881 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
881 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.81 
 
 
893 aa  79  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
876 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
894 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.47 
 
 
1468 aa  78.2  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.36 
 
 
992 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  29.16 
 
 
940 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40 
 
 
189 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.43 
 
 
1160 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.14 
 
 
959 aa  74.7  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.7 
 
 
1014 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.32 
 
 
1175 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
881 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.49 
 
 
1190 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
1105 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 
947 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.86 
 
 
1080 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.13 
 
 
947 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.97 
 
 
900 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.67 
 
 
1118 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
1271 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 
1297 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  24.65 
 
 
1005 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  22.76 
 
 
1048 aa  67.8  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 
938 aa  67.8  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>