More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2323 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  100 
 
 
955 aa  1850    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  60 
 
 
961 aa  909    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  60.13 
 
 
934 aa  893    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  45.64 
 
 
923 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  41.68 
 
 
922 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 
928 aa  376  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 
927 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.29 
 
 
884 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  33.85 
 
 
892 aa  282  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 
925 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 
928 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.44 
 
 
923 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
938 aa  241  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 
909 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 
917 aa  224  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.29 
 
 
928 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 
930 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 
918 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.19 
 
 
919 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 
946 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.61 
 
 
929 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40.14 
 
 
929 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.76 
 
 
940 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  38.7 
 
 
919 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.05 
 
 
913 aa  179  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  40.13 
 
 
905 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 
920 aa  172  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 
903 aa  171  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
923 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.07 
 
 
879 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.32 
 
 
913 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 
940 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 
911 aa  161  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
889 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 
904 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
936 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 
894 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 
927 aa  156  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.15 
 
 
913 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  35.83 
 
 
884 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 
910 aa  142  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
916 aa  131  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 
1064 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
919 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.19 
 
 
919 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.19 
 
 
919 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  38.86 
 
 
240 aa  121  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 
915 aa  114  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.98 
 
 
995 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 
927 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.07 
 
 
923 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.11 
 
 
929 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  38.84 
 
 
937 aa  108  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
937 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.84 
 
 
937 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
953 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  26.79 
 
 
893 aa  106  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  33.76 
 
 
997 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  30.39 
 
 
900 aa  100  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 
916 aa  97.8  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.05 
 
 
977 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 
954 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 
959 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
1000 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.65 
 
 
921 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.97 
 
 
921 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
876 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
921 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.41 
 
 
921 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.48 
 
 
1055 aa  88.2  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 
1094 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 
1142 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 
992 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 
947 aa  86.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
940 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.97 
 
 
1075 aa  85.1  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 
1005 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 
967 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
881 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
881 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 
835 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.08 
 
 
1081 aa  82  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.91 
 
 
1080 aa  82  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
950 aa  81.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 
960 aa  79.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 
897 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 
1013 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
973 aa  78.2  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.19 
 
 
1295 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
966 aa  77.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 
900 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.61 
 
 
1006 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.68 
 
 
1151 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.67 
 
 
1122 aa  75.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.6 
 
 
947 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 
1422 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
881 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.46 
 
 
1468 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 
894 aa  72.4  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>