More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2312 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  47.01 
 
 		 491 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  48.7 
 
 		 449 aa  94.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  45.3 
 
 		 165 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  41.79 
 
 		 142 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 139 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 120 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 124 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  43.36 
 
 		 128 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 118 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  43.24 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  35.65 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  40.35 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  28.93 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  33.05 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  37.88 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  33.91 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 137 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  27.41 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 118 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  28.69 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  22.81 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  29.17 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  31.19 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  32.38 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  28.46 
 
 		 129 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>