More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2172 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
345 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2531  ABC transporter permease  54.52 
 
 
330 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24430  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.78 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 
356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
316 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112233  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1600  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.73 
 
 
313 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7203  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.79 
 
 
348 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
319 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2383  dipeptide ABC transporter  41.94 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
332 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
321 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.923467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.27 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
330 aa  212  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353707  normal  0.0409254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
321 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
319 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
316 aa  198  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.544656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 
316 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
308 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18680  ABC transporter, inner membrane permease component  40.39 
 
 
318 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
338 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.23 
 
 
316 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
319 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2959  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.58 
 
 
316 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
314 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3089  nickel ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
316 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
321 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
315 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
314 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
306 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
306 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.43 
 
 
306 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  34.63 
 
 
327 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
306 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
306 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.24 
 
 
306 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
307 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  33.77 
 
 
307 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
320 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
306 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  33.99 
 
 
306 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
306 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.26 
 
 
315 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 
306 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
306 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
306 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
311 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 
306 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
306 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  33.99 
 
 
306 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
311 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.11 
 
 
306 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
329 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.08 
 
 
313 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
313 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
334 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
313 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.3 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0332044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
314 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
334 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>