More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2132 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  100 
 
 
344 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  57.41 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  52.09 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  46.88 
 
 
329 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  47.96 
 
 
315 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  44.65 
 
 
323 aa  198  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  44.21 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  38.91 
 
 
317 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  44.51 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  41.38 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 
301 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  45.03 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40.87 
 
 
316 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  41.69 
 
 
316 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  39.51 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  36.96 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  44.07 
 
 
321 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  39.13 
 
 
340 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  39.27 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  41.38 
 
 
316 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  38.91 
 
 
316 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  39.01 
 
 
339 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 
301 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  38.27 
 
 
320 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  38.48 
 
 
327 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  39.06 
 
 
328 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  44.01 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  34.37 
 
 
319 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  38.58 
 
 
345 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  39.56 
 
 
314 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  39.63 
 
 
324 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.51 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.51 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.51 
 
 
330 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  40.74 
 
 
326 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.44 
 
 
329 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  40.44 
 
 
329 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  38.23 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.27 
 
 
318 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  40.13 
 
 
329 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.13 
 
 
329 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  37.35 
 
 
317 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  37.99 
 
 
329 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.07 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.88 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  38.07 
 
 
329 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  39.62 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.55 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.12 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  35.16 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.25 
 
 
330 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 
320 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  36.7 
 
 
329 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  36.62 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  35.87 
 
 
306 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  43.73 
 
 
321 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  39.32 
 
 
316 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  34.78 
 
 
332 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.72 
 
 
313 aa  135  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  33.77 
 
 
317 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.16 
 
 
318 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.91 
 
 
291 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31 
 
 
320 aa  132  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.22 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  35.06 
 
 
314 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.71 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.58 
 
 
317 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  36.18 
 
 
309 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  37.85 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  35.21 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  35.21 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.58 
 
 
320 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  29.56 
 
 
338 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  30.03 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  30.03 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  32.33 
 
 
333 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 
320 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.89 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.44 
 
 
308 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  37.33 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  26.61 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  35.31 
 
 
316 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.83 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  26.51 
 
 
590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.82 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  27.71 
 
 
340 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  34.74 
 
 
308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.81 
 
 
320 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  29.43 
 
 
341 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
308 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.32 
 
 
308 aa  109  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.42 
 
 
342 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>