17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2113 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  100 
 
 		 100 aa  192  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  68.37 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  51.52 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  54.08 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  51.04 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  46.46 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  52.69 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  36.46 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  43.56 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  36.73 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  51.14 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  38.2 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1951  hypothetical protein  38.64 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3094  PilT protein-like  38.71 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  31.46 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>