214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2056 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  893    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.04 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  54.74 
 
 
428 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.95 
 
 
427 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 
430 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  56.05 
 
 
429 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  56.3 
 
 
429 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.83 
 
 
422 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  54.42 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.22 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 
422 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  56.19 
 
 
415 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  54.57 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  52.21 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.03 
 
 
428 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  50.12 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  47.01 
 
 
433 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  47.6 
 
 
433 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
419 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  40.05 
 
 
419 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  41.83 
 
 
450 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  41.69 
 
 
450 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
423 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  41.03 
 
 
435 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
425 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
449 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
459 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  41.85 
 
 
470 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  41.26 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  39.22 
 
 
439 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.36 
 
 
448 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  38.97 
 
 
439 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 
439 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  39.66 
 
 
439 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  41.18 
 
 
446 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
441 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  38.44 
 
 
417 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
440 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  41.23 
 
 
412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  37.5 
 
 
419 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  41.65 
 
 
427 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  39.34 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  41.22 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.15 
 
 
399 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  43.39 
 
 
419 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  37.38 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.89 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.68 
 
 
377 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  26.43 
 
 
343 aa  159  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.02 
 
 
360 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
372 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.87 
 
 
349 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.94 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.94 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  35.94 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  35.48 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  35.48 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  36.87 
 
 
344 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.63 
 
 
361 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.24 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  36.81 
 
 
347 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
378 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  38.12 
 
 
347 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  34.1 
 
 
347 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.86 
 
 
352 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  27.27 
 
 
352 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.54 
 
 
358 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.25 
 
 
399 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.15 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.93 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.15 
 
 
381 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.15 
 
 
381 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.81 
 
 
381 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  34.84 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  32.97 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.38 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.05 
 
 
362 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.03 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.78 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.62 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  24.59 
 
 
364 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.27 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.12 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.05 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.81 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  34.01 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.11 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.43 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.78 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2987  putative potassium transport flavoprotein  25.54 
 
 
226 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.819627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  28.8 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.21 
 
 
348 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>