44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2040 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 201 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  47.1 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  36.41 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  40.64 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  36.65 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  40.94 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  38.31 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  40.13 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35.48 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  29.44 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  34.04 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35.12 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  34.52 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  36.31 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  35.54 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  30.18 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  32.09 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  33.92 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  30.36 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  33.15 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 102 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 472 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 95 aa  42.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 109 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 100 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>