More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2001 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  100 
 
 		 318 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.57 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  66.45 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  66.67 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  65 
 
 		 319 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  66.99 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  68 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  62.18 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  62.97 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  66.56 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  64.45 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.92 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 319 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  59.6 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  64.9 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  59.68 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57.96 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  60.65 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 314 aa  348  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  60.93 
 
 		 313 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  62.46 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  65.23 
 
 		 304 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  58.94 
 
 		 306 aa  341  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  60.73 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  53.94 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.83 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  58.68 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  56.5 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  57.14 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  56.04 
 
 		 373 aa  329  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.28 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  58.33 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  58.33 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  58.33 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60.6 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 310 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  56.27 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  71.43 
 
 		 252 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  55.12 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.25 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56.03 
 
 		 301 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.52 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  70.09 
 
 		 241 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.85 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  47.45 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.97 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  51.75 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  53.16 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  58 
 
 		 304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  54.3 
 
 		 303 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.23 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  62.2 
 
 		 398 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.68 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 316 aa  275  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  52.51 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  48.97 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  50.17 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.13 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  50 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.55 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  57.48 
 
 		 234 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.6 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  45.82 
 
 		 305 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  43.37 
 
 		 457 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.31 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  51.69 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  55.96 
 
 		 242 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  45.79 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  50 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.33 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.63 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 496 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.33 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  47.19 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 237 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.98 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.52 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.83 
 
 		 238 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  53.02 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.63 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.42 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.43 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.33 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  42.04 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.9 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>