More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1963 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  68.33 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  59.43 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  58.22 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  57.47 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.45 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  52.65 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  53.68 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  55.04 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.85 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 247 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  61.92 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.78 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  53.25 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.33 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  52.1 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  53.59 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  54.19 
 
 		 445 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  52.38 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  52.28 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  52.72 
 
 		 250 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.04 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  54.11 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  54.17 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  59.51 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  57.8 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  53.25 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.91 
 
 		 280 aa  232  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  53.59 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  57.59 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  53.33 
 
 		 293 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  56.52 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.33 
 
 		 274 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  54.07 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  53.88 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.68 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  53.3 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  54.5 
 
 		 288 aa  224  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.09 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 279 aa  218  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  53.07 
 
 		 312 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  51.46 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.09 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  53.88 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  52.86 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  51.34 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 229 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.08 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 302 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.8 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  51.83 
 
 		 224 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.7 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  52.47 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  49.78 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  49.55 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  47.09 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.54 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.49 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  44.95 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  51.33 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  45.09 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>