135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1911 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  67.07 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  71.2 
 
 		 250 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  70.8 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  64.66 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  48.21 
 
 		 412 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  50 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  45.74 
 
 		 408 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  48.63 
 
 		 407 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  47.84 
 
 		 409 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  48.05 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  49.03 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  46.3 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  40.96 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  47.18 
 
 		 405 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  43.08 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  47.18 
 
 		 423 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  47.47 
 
 		 407 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  42.8 
 
 		 402 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  45.56 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  40.39 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  44.75 
 
 		 410 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  43.19 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  42.91 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  45.2 
 
 		 409 aa  201  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  40.64 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  45.16 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  41.04 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  49.21 
 
 		 418 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  42.8 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  43.97 
 
 		 410 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  42.8 
 
 		 410 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  47.51 
 
 		 408 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  47.13 
 
 		 408 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  47.18 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  40.66 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  37.3 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  35.57 
 
 		 411 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.56 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.45 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.4 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.19 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  26.72 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  28.57 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.3 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.21 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  29.09 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.11 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.73 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.24 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  32.33 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.44 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  23.88 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.24 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.1 
 
 		 645 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.2 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  26.29 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23.86 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.6 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  29.61 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  22.64 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  26.56 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  27.75 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  21.67 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  20.85 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  25.69 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  20 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 424 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  24.75 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  24.76 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0292  putative hydrolase  28.44 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  22.73 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24 
 
 		 771 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  31.34 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  20.93 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  20.93 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  23.87 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  24.73 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.5 
 
 		 767 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  21.1 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  34.51 
 
 		 638 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  26.14 
 
 		 634 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  28.46 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.5 
 
 		 771 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  35.09 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  34.69 
 
 		 638 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>