More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1870 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
398 aa  767    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  60.3 
 
 
394 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  56.39 
 
 
395 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  56.28 
 
 
394 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  42.01 
 
 
409 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  40.64 
 
 
405 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  40.69 
 
 
409 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  42.51 
 
 
405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.46 
 
 
409 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.55 
 
 
407 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
405 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  40.89 
 
 
409 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40.67 
 
 
415 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  38.38 
 
 
394 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  38.63 
 
 
406 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  40.99 
 
 
409 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  37.71 
 
 
406 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.82 
 
 
405 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
405 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  40.99 
 
 
409 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
405 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  36.76 
 
 
391 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
405 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  41.25 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  37.91 
 
 
405 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  39.67 
 
 
414 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  40.89 
 
 
408 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  41.48 
 
 
409 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  38.69 
 
 
405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  38.69 
 
 
405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  42.17 
 
 
402 aa  249  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  37.16 
 
 
443 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.48 
 
 
412 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 
409 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
406 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  35.8 
 
 
410 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  38.75 
 
 
392 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  35.8 
 
 
410 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  35.32 
 
 
409 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  37.19 
 
 
401 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  34.34 
 
 
398 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  39.02 
 
 
410 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  36.34 
 
 
409 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  36.34 
 
 
409 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
401 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
404 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 
406 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  35 
 
 
406 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.6 
 
 
403 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
408 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.01 
 
 
394 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  34.83 
 
 
412 aa  232  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  37.01 
 
 
400 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  38.03 
 
 
411 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.41 
 
 
418 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.36 
 
 
644 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 
402 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  37.47 
 
 
402 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.88 
 
 
402 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  36.27 
 
 
657 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  36.39 
 
 
400 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  37.65 
 
 
409 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  38.04 
 
 
400 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.89 
 
 
409 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  36.12 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.76 
 
 
408 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.62 
 
 
663 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  34.8 
 
 
404 aa  222  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  35.7 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  34.56 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  36.97 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  36.97 
 
 
399 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.41 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  35.68 
 
 
397 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  36.87 
 
 
387 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.26 
 
 
651 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 
420 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  37.07 
 
 
656 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.6 
 
 
661 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  33.82 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37 
 
 
653 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  37.38 
 
 
409 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  37.62 
 
 
409 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  34.31 
 
 
403 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.75 
 
 
653 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.84 
 
 
663 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  40.45 
 
 
648 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  38.02 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  38.29 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 
420 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  37.35 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  37.16 
 
 
402 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 
416 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  35.84 
 
 
652 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.75 
 
 
671 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  36.32 
 
 
653 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>