119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1867 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 183 aa  355  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  32.5 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  32.5 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  35.03 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  34.62 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.93 
 
 		 459 aa  71.6  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  34.38 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  40.13 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  38.06 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  33.74 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  33.74 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  33.74 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  33.74 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  33.74 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  27.57 
 
 		 451 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.61 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  32.96 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.47 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  36.96 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  34.45 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.82 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.54 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.19 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  36.28 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1495  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  32.76 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.59 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3465  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.592671  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.21 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 298 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.36 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.2 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  36.26 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.78 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.83 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  37.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  29.29 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  37.84 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  39.34 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 148 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 136 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.21 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 331 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 183 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>