113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1823 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  100 
 
 
386 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.83 
 
 
312 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.81 
 
 
261 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.6 
 
 
242 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.35 
 
 
258 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  47.19 
 
 
177 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  38.52 
 
 
143 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  38.28 
 
 
148 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  36.51 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  37.07 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  36.21 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  40 
 
 
486 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.62 
 
 
152 aa  62.8  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  42.53 
 
 
488 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  41.86 
 
 
163 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  41.67 
 
 
163 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.82 
 
 
238 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.18 
 
 
242 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  37.08 
 
 
488 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  41.86 
 
 
163 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  38.26 
 
 
146 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  35.56 
 
 
501 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  29.17 
 
 
158 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  41.98 
 
 
484 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  34.23 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0415  rfaE bifunctional protein  36.89 
 
 
496 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0298822  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.39 
 
 
247 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  35.11 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  37.11 
 
 
482 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  31.96 
 
 
151 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  37.65 
 
 
490 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  38.37 
 
 
160 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  37.89 
 
 
169 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  33.68 
 
 
487 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  38.83 
 
 
172 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  38.89 
 
 
461 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  32.29 
 
 
490 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  27.06 
 
 
158 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  36.47 
 
 
490 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  38.64 
 
 
488 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  30.84 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  36.56 
 
 
562 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4360  rfaE bifunctional protein  36.56 
 
 
643 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  34.86 
 
 
162 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  36.05 
 
 
490 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  33.68 
 
 
487 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  37 
 
 
455 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.51 
 
 
655 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  35 
 
 
164 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  45 
 
 
129 aa  49.7  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1184  rfaE bifunctional protein  35.37 
 
 
154 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  32.11 
 
 
170 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1792  bifunctional ADP-heptose synthase  31.11 
 
 
491 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  31.76 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0361  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.12 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1065  rfaE bifunctional protein  36.9 
 
 
164 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  32.69 
 
 
163 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  29.76 
 
 
163 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1432  bifunctional ADP-heptose synthase  35 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.87 
 
 
685 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  33.71 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.31 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  40.79 
 
 
496 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.21 
 
 
132 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2823  rfaE bifunctional protein  31.87 
 
 
200 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  26.37 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  35.96 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1071  cytidyltransferase-related, RfaE bifunctional protein  31.87 
 
 
488 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136639  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66060  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33 
 
 
474 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0209  cytidyltransferase-like protein  32.29 
 
 
148 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
158 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  37.5 
 
 
132 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.03 
 
 
499 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0310  cytidyltransferase-related domain protein  33.68 
 
 
153 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.531506  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1846  rfaE bifunctional protein  38.1 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  29.25 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.11 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.97 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  34.12 
 
 
490 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  34.15 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2196  cytidyltransferase-related  30.91 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1603  bifunctional D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase/D-beta-D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase  36.14 
 
 
490 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  40.96 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  31.52 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5043  cytidyltransferase-related domain protein  28.74 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.516423  normal  0.0391511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  30.53 
 
 
477 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  30.77 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.88 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4507  rfaE bifunctional protein  35 
 
 
490 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.9 
 
 
200 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0408  hypothetical protein  35.21 
 
 
140 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0199555  hitchhiker  0.00270844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  40 
 
 
131 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  29.21 
 
 
485 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>