88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1611 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 805 aa  1516    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1750 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1030 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1351 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 		 850 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1026 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.77 
 
 		 439 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1763 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  27.91 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 772 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.79 
 
 		 1292 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.42 
 
 		 2296 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1051 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.19 
 
 		 831 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 841 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.97 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.24 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  36.31 
 
 		 664 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.46 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.18 
 
 		 1079 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 863 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.4 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.26 
 
 		 693 aa  72.4  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.96 
 
 		 1130 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1163 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1834 aa  70.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.1 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.58 
 
 		 963 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1146 aa  67.8  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.98 
 
 		 2449 aa  67.4  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  31.37 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  25.23 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.21 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.42 
 
 		 1293 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  24.15 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.99 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  29.55 
 
 		 2831 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 		 770 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1030 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.91 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.15 
 
 		 676 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  29.2 
 
 		 1046 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 387 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 732 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  25.18 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.55 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  28.06 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  22.43 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 581 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.56 
 
 		 2039 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 2961 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34.64 
 
 		 2042 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.59 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 		 390 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  26.23 
 
 		 1916 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.53 
 
 		 391 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.49 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  29.65 
 
 		 1140 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  44.14 
 
 		 840 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.76 
 
 		 1199 aa  52.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.07 
 
 		 930 aa  51.2  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1177 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  24.91 
 
 		 302 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.13 
 
 		 830 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.52 
 
 		 1879 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  29.32 
 
 		 621 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.62 
 
 		 709 aa  48.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  35.92 
 
 		 633 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 756 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  45.54 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  35.35 
 
 		 504 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.59 
 
 		 652 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.95 
 
 		 2350 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  35.24 
 
 		 9585 aa  47.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.55 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  34.6 
 
 		 1706 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.69 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.23 
 
 		 1096 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  32.37 
 
 		 1000 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.46 
 
 		 1394 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  29.89 
 
 		 423 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.02 
 
 		 2476 aa  46.2  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  38.78 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>