46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1575 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  82.2 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  60.83 
 
 		 266 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  56.95 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  55.31 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  49.33 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  42.86 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  45.61 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  32.51 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  29.63 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.51 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.51 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.15 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  29.67 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.69 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  31.45 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.17 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  41.82 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  28.09 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  31.82 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  23.9 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  41.11 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.09 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.6 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.09 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  28.69 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  28.28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  28.28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  32.79 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  29.03 
 
 		 630 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  28.28 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3650  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.45 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.35 
 
 		 374 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>