More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1536 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  100 
 
 		 319 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  62.34 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  52.53 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  51.58 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  51.1 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  48.72 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  53.24 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  52.08 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  47.32 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  45.86 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  46.01 
 
 		 328 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  46.62 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  46.03 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  46.71 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  48.39 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  48.39 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  48.39 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  44.95 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  44.55 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.11 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  37.67 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  43.89 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  38.39 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.73 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  40.74 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.73 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.73 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  35.85 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  37.37 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.35 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.52 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.27 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  40.62 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  39.62 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.41 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  39.93 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  38.23 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  38.78 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  39.41 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.03 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  34.74 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  43.01 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  31.4 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.11 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  35.74 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.08 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  31.88 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.38 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.46 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  39.39 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  36.82 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.05 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  37.41 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  41.32 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  36.3 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  36.3 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  37.06 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  36.58 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.36 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  34.9 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  26.54 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.06 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.69 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  40.23 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  35.62 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  39.24 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  36.15 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  37.88 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  37.54 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  36.88 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  36.07 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  36.88 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  36.15 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>