More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1504 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  56.95 
 
 		 674 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  56.12 
 
 		 684 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  58.68 
 
 		 685 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  59.57 
 
 		 728 aa  659    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55 
 
 		 694 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  55.22 
 
 		 681 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  53.94 
 
 		 699 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  56.47 
 
 		 665 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  57 
 
 		 676 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  58.65 
 
 		 765 aa  688    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  57.92 
 
 		 690 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  56.89 
 
 		 692 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  58.71 
 
 		 696 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  56.47 
 
 		 665 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.18 
 
 		 666 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  56.47 
 
 		 665 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.69 
 
 		 706 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  100 
 
 		 672 aa  1305    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  54.72 
 
 		 673 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.97 
 
 		 706 aa  625  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  55.59 
 
 		 677 aa  621  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  54.27 
 
 		 699 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  54.81 
 
 		 670 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  54.33 
 
 		 664 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  53.34 
 
 		 669 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  53.48 
 
 		 676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  53.42 
 
 		 683 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  54.19 
 
 		 699 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  55.75 
 
 		 679 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  49.49 
 
 		 664 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  51.92 
 
 		 710 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  52 
 
 		 844 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.13 
 
 		 636 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.23 
 
 		 674 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  33.58 
 
 		 646 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.78 
 
 		 634 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  34.61 
 
 		 743 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.98 
 
 		 707 aa  289  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  35.16 
 
 		 725 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.4 
 
 		 660 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.1 
 
 		 646 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  35.55 
 
 		 725 aa  286  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.03 
 
 		 643 aa  286  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  34.57 
 
 		 876 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  33.03 
 
 		 651 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.64 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  35.38 
 
 		 713 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.96 
 
 		 754 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.93 
 
 		 674 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.27 
 
 		 646 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  33.83 
 
 		 840 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.77 
 
 		 659 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.28 
 
 		 639 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  276  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.36 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  34.67 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.18 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.49 
 
 		 927 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.69 
 
 		 930 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.23 
 
 		 639 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.94 
 
 		 650 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.04 
 
 		 934 aa  273  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.77 
 
 		 633 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  34.36 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.63 
 
 		 659 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.21 
 
 		 636 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  34.9 
 
 		 639 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.76 
 
 		 641 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.76 
 
 		 641 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  31.01 
 
 		 662 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.93 
 
 		 669 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.7 
 
 		 709 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.24 
 
 		 639 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.78 
 
 		 640 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.79 
 
 		 664 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  30.43 
 
 		 640 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.32 
 
 		 729 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.38 
 
 		 651 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.42 
 
 		 631 aa  270  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  35.02 
 
 		 649 aa  270  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.51 
 
 		 921 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  35.46 
 
 		 633 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  30.47 
 
 		 641 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.28 
 
 		 669 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.73 
 
 		 633 aa  267  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.59 
 
 		 659 aa  266  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.41 
 
 		 647 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.62 
 
 		 658 aa  265  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  31.83 
 
 		 645 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>