More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1503 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  100 
 
 		 530 aa  1045    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  69.64 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  69.23 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  65.35 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  70.5 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  68.63 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  71.18 
 
 		 521 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  74.44 
 
 		 493 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  63.92 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  70.84 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  70.64 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  70.46 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  70.28 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  70.44 
 
 		 485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  63.62 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  67.01 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.52 
 
 		 493 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  67.22 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  65.3 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  65.19 
 
 		 487 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  63.79 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  64.38 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.67 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  66.15 
 
 		 524 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  63.77 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  60.4 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  61.89 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  62.77 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  61.77 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  61.99 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  61.77 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  60.14 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  60.72 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  64.1 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  63.88 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  61.98 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  58.74 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  61.54 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.92 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.6 
 
 		 421 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.84 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.63 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  59.28 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.81 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  42.96 
 
 		 395 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.99 
 
 		 444 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.79 
 
 		 437 aa  307  4.0000000000000004e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.37 
 
 		 413 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.5 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.48 
 
 		 582 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.62 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.03 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.47 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  37.32 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.26 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.03 
 
 		 419 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.49 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.03 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  38.26 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  38.26 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  37.79 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  37.79 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  42.92 
 
 		 454 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.55 
 
 		 415 aa  291  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  41.36 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.06 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.08 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.08 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.33 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  43.01 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 		 435 aa  286  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  40.57 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1093  GTP-binding proten HflX  36.96 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000358907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.22 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  39.59 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.96 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  41.94 
 
 		 414 aa  280  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  41.25 
 
 		 414 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  43.01 
 
 		 433 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  43.01 
 
 		 433 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  43.75 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  43.01 
 
 		 433 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  46.55 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  40.77 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.69 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  40.63 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  39.66 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  40.63 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  42.78 
 
 		 429 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  41.01 
 
 		 430 aa  276  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  40.63 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.43 
 
 		 441 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  40.35 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  39.53 
 
 		 431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  42.6 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  40.49 
 
 		 421 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  42.22 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>