238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1471 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  38.49 
 
 
257 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  42.72 
 
 
273 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.55 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  32.95 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  30.95 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  41.27 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  38.71 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  27.23 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.84 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.02 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.58 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  41.27 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  46.39 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  29.57 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  38.71 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  29.57 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  39.39 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  39.37 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  29.91 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.9 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  42.2 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  35.48 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  35.77 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.42 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  34 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  34 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.68 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
495 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  27.86 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  28.24 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  28.22 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  31.88 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  30.99 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35.45 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  30 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  31.54 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
415 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48590  hypothetical protein  28.15 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00740974  normal  0.0133617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.19 
 
 
280 aa  52.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.28 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
272 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  28.91 
 
 
258 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  29.85 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  41.72 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  40.69 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  33.62 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.11 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>